aa-pair-analysis

蛋白质氨基酸功能类别相邻对频率分析。对给定分类群的蛋白质序列进行多序列比对（MSA）、共识序列提取、对型统计和配方计算，输出Top5高频对型及φ值。适用于：（1）对新物种/类群运行完整分析流程，（2）从已有共识序列进行对型统计，（3）与文献结果对比验证，（4）修改氨基酸分类或统计参数后重新分析。